Согласно этому документу наибольшим преследованиям подвергаются иеговисты.
Неправительственная организация "Центр по правам человека" подготовила отчёт о качестве свободы национальных меньшинств в Грузии после оформления соглашения между государством и Патриархией в 2002 году. В документе, выдержки из которого публикует еженедельник "Головинский проспект", отмечается, что по сравнению с 1990-ми годами случаи проявления религиозного экстремизма уменьшились, но возникают проблемы другого рода. На сегодняшний день жертвами агрессии чаще всего становятся приверженцы новых религий, в основном "Свидетели Иеговы". По информации "Центра по правам человека", после оформления соглашения, Грузинская Православная Церковь оказалась в привилегированном положении – от налогов освобождается только она, днями отдыха объявлены только православные праздники, и т.д. "Это даёт возможность сделать вывод, что религиозные меньшинства находятся в дискриминированном положении", – говорится в документе. Кроме этого, представителям религиозных меньшинств по сей день трудно вернуть имущество, отнятое при советской власти.
Дискриминацию узрела НПО и в образовательной системе. На финансирование религиозной учёбы госбюджет выделил более 9 миллионов лари, но в школах дети получают знания не о религии в общем, а непосредственно о православии. В последние годы появилась ещё одна тенденция: политические партии активно пытаются манипулировать религиозной тематикой.
