Коллектив Церковно-научного центра Русской Православной Церкви "Православная энциклопедия" начал создаваться на базе отдела классической литературы журнала "Литературная учеба", которым заведовал нынешний руководитель ЦНЦ Cергей Кравец. Сотрудники этого отдела "Литературной учебы" составили костяк издательства Валаамского монастыря, которое было учреждено указом Патриарха Алексия II в 1991 г. по инициативе игумена Андроника (Трубачева) – тогдашнего наместника Валаамского монастыря.
Издательство сразу "взяло курс" на выпуск серьезной церковно-научной литературы – в противовес многим другим церковным издательствам, выпускавшим молитвословы и разного рода церковные брошюры, порой сомнительного содержания.
После того как наместником Валаамского монастыря стал архимандрит Панкратий (Жердев), коллектив издательства и подворье Валаамского монастыря продолжали сотрудничество, невзирая на идейные различия. Главным достижением Сергея Кравца и работавшего под его руководством издательства стало издание к концу 1996 г. многотомной "Истории Русской Церкви" (митрополита Макария). Патриарх Алексий II взял издательство под свой патронат, последовал указ о его преобразовании в Церковно-научный издательский центр "Православная энциклопедия" (сокр. ЦНЦ ПЭ).
В основу проекта ЦНЦ ПЭ была положена идея проф. Бенешевича о сотрудничестве церковной и светской науки. В целом, перед церковными учеными ставилась задача помочь светской науке выработать инструментарий, позволяющий описывать церковные явления "изнутри", основываясь на логике, структуре и жизни самой Церкви (то есть придерживаясь некоего конфессионального взгляда, языка, подходов). В принципе, это означало попытку РПЦ МП сформировать свое цельное православное мировоззрение, отвечающее современному общекультурному и научному уровню, за счет обогащения его достижениями гуманитарной науки и естественнонаучных знаний.
Портал-Credo.Ru, 10 января 2003 [вся статья]